崇祯三年八月时，他被朱由检秘密凌迟处死，家人也都被流放边远之地，并且没收最后的一点家产 。他的一生也算得是有起有落，只是这最后的结局太不圆满罢了，一生忠良，却为人陷害，不得君主信任，遗憾而死 。
乾隆在知晓了他被冤枉陷害的种种以后，便下令洗清了他的冤屈，并因为推崇他如此忠诚之举，还特地派人到他的老家东莞去寻找他的后人，想要重用他的后人 。
当然乾隆如此大张旗鼓地为袁崇焕平反冤屈，可不仅仅是因为他是一位忠臣，更多地是想要借此方式，让朝中的臣子们明白 ， 身为臣子便该做如袁崇焕一般的忠臣 。也是想天下人知道他是一位明君 ， 说到底便是出于政治的目的 。

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