这类疫苗能够预防一些宝宝易感而且危害较大的传染病 ， 例如b型流感嗜血杆菌结合疫苗（HIB）预防相应感染引起的肺炎、脑膜炎等传染病；肺炎疫苗预防相应感染引起的肺炎、中耳炎等疾病；水痘疫苗预防水痘及其并发症如皮肤感染、肺炎和脑炎；轮状病毒疫苗预防相应感染引起的秋季腹泻等 。
也有些第二类疫苗能够提供更安全的接种方式 ， 例如脊灰灭活疫苗（IPV）不仅与口服脊灰减毒活疫苗（OPV）一样有效预防小儿麻痹症 ， 而且避免了OPV可能导致的麻痹病例问题 。
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