由于对表观遗传因素的遗传影响的新图谱,了解导致表观遗传变异的原因可能更近了一步 。该图谱由包括埃克塞特大学研究人员在内的国际财团建立,将使科学家能够更多地了解支持基因调控的机制 。
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表观遗传变异存在,但不清楚是什么导致了这种变异——是遗传还是环境?目前还不清楚个体之间发生的遗传差异如何影响我们的表观基因组 。DNA 甲基化遗传效应图谱 (DNAm),由 50 所大学和研究所和 150 多位科学家组成的 DNA 甲基化联盟 (GoDMC),包括布里斯托大学、埃克塞特大学医学院、伦敦国王学院和莱顿大学大学医学中心,发表在Nature Genetics 上 。
该分析侧重于个体之间在整个基因组中 DNAm 水平的自然差异 。DNAm 在基因调控中起着核心作用 。它有助于确定细胞如何对环境信号做出反应,并最终促进健康或对疾病的易感性 。然而,人们对DNAm差异的数量和影响知之甚少 。
研究 DNAm 水平变化的生物学后果的一个有力途径是系统地比较 DNA 序列变异与 DNAm 水平 。GoDMC 通过扫描基因组中 1000 万个遗传变异和 420,000 个 DNAm 位点之间的相关性,完成了迄今为止最大的 DNAm 遗传研究,从而形成了一个包含 >270,000 个独立关联的数据库 。这意味着基因组中几乎一半的 DNAm 位点在某种程度上受到遗传因素的影响 。
该国际联盟分析了从全球 38 项研究中收集的 32,851 名参与者 。通过提供一个全球性的合作平台以及结合遗传学和流行病学专业知识,GoDMC 的科学家们建立了大量的 DNAm 遗传效应资源,以及如何使用该图谱来了解 DNAm 变异的遗传基础 。该图集已被广泛用于其他研究项目 。
新开发的数据库已用于搜索与 100 种临床特征和疾病有因果关系的 DNAm 位点实例 。相反,该研究估计了这些临床特征和疾病对整个基因组 DNAm 水平的因果影响 。这些比较突出表明 DNAm 不太可能在引起疾病方面发挥重要作用,但它们为一系列进一步研究打开了大门 。例如,这项工作表明,通过研究基因组的其他调控区域或其他细胞类型,可以提高对个体之间 DNAm 变异及其对健康和疾病影响的理解 。
埃克塞特大学的 Jonathan Mill 教授是该项目的主要研究人员之一,他说:“这是一项涉及来自世界各地的科学家的巨大合作努力 。这项研究使我们能够探索遗传学和表观遗传学如何相互作用,生成一个无与伦比的数据集,可用于阐明健康和疾病的因果机制 。”
【国际研究报告遗传学对表观遗传因素的影响】布里斯托尔大学遗传和表观遗传流行病学研究员兼 GoDMC 协调员 Josine Min 博士说:“了解包含不同细胞类型的组织之间遗传调控的差异是复杂的 。我们对 DNAm 和遗传学的大规模比较血液、大脑和脂肪组织强调,长距离调节在很大程度上在组织之间共享,但局部调节更具组织特异性 。更好地了解不同组织如何发展和对疾病的反应将有助于促进我们对疾病原因的理解 。”
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