第二阶段，流程的分析、诊断和重新设计 。分为九个子步骤：组建和培训再造团队；设定流程再造结果；诊断现有流程；诊断环境条件；寻找再造标杆；重新设计流程；根据新流程考量现有人员队伍；根据新流程考量现有技术水平；对新流程设计方案进行检验 。
第三阶段，组织架构的重新设计 。分为六个子流程：检查组织的人力资源情况；检查技术结构和能力情况；设计新的组织形式；重新定义岗位，培训员工；组织转岗；建立健全新的技术基础结构和技术应用 。
第四阶段，试点与转换阶段 。分为六个子流程：选定试点流程；组建试点流程团队；确定参加试点流程的客户和供应商；启动试点、监控并支持试点；检验试点情况，听取意见反馈；确定转换顺序，按序组织实施 。
第五阶段，实现愿景 。分为四个子流程：评价流程再造成效；让客户感知流程再造产生的效益；挖掘新流程的效能；持续改进 。
通常来说，五大阶段应该顺序推进，但是，根据企业各自的情况，五大阶段可以彼此之间平行推进，或者交叉进行 。所以说，五大阶段并不是一个锁定的线性过程，而是相互交融，循环推进的不断再生的过程 。
威廉姆·J·凯丁格的六阶段模式 威廉姆·J·凯丁格等人在调查33家咨询公司在企业推行流程再造的实践经验以后，归纳出了流程再造的六个阶段21项任务 。第一阶段，构思设想 。
包括有四项任务：得到管理者的承诺和管理愿景；发现流程再造的机会；认识信息技术/信息系统的潜力；选择流程 。第二阶段，项目启动 。
包括有五项任务：通知股东；建立再造小组；制定项目实施计划和预算；分析流程外部客户需求；设置流程创新的绩效目标 。第三阶段，分析诊断 。
包括两项任务：描述现有流程；分析现有流程 。第四阶段，流程设计 。
包括四项任务：定义并分析新流程的初步方案；建立新流程的原型和设计方案；设计人力资源结构；信息系统的分析和设计 。第五阶段，流程重建 。
包括有四项任务：重组组织结构及其运行机制；实施信息系统；培训员工；新旧流程切换 。第六阶段，监测评估 。
包括有两项任务：评估新流程的绩效；转向连续改善活动 。芮明杰和袁安照的七阶段模式 在国内，芮明杰、袁安照较早对流程再造的步骤进行了研究，他们认为应该包含七个阶段31个子步骤 。
第一阶段，设定基本方向 。分为五个子步骤：明确企业战略目标，将目标分解；成立再造流程的组织机构；设定改造流程的出发点；确定流程再造的基本方针；给出流程再造的可行性分析 。
第二阶段，现状分析 。分为五个子步骤：企业外部环境分析；客户满意度调查；现行流程状态分析；改造的基本设想与目标；改造成功的判别标准 。
第三阶段，确定再造方案 。分为六个子步骤：流程设计创立；流程设计方案；改造的基本路径确定；设定先后工作顺序和重点；宣传流程再造；人员配备 。
第四阶段，解决问题计划 。分为三个子步骤：挑选出近期应该解决的问题；制定解决此问题的计划；成立一个新小组负责实施 。
第五阶段，制订详细再造工作计划 。分为五个子步骤：工作计划目标、时间等确认；预算计划；责任、任务分解；监督与考核办法；具体的行动策略与计划 。
第六阶段，实施再造流程方案 。分为五个子步骤：成立实施小组；对参加人员进行培训；发动全员配合；新流程试验性启动、检验；全面开展新流程 。
第七阶段，继续改善的行为 。分为三个子步骤：观察流程运作状态；与预定改造目标比较分析；对不足之处进行修正改善 。